Die Systemsteuerung beinhaltet die meisten DSM-Einstellungen in einem einfach zu bedienenden Fenster, um Synology NAS mit dem Netzwerk zu verbinden, den Zugriff darauf über das Internet zu ermöglichen, Filesharing (oder Dateifreigabe) einzurichten, Anwendungsberechtigungen zu steuern, System- und Hardware-Einstellungen zu verwalten und noch Vieles mehr.